Ordet ekorre har en svårtydd etymologi och det är inte entydigt att namnet har samband med ek, förleden kan komma av ett äldre ord för "rörlig" eller vara ljudhärmande. Dialektala namn på ekorren är bland annat _granoxe_, _gråskinn_, _kurre_, _furufnatt_ och _fnatt_[\[3\]](https://sv.wikipedia.org/wiki/Ekorre#cite_note-ax-3). Det svenska ordet för ekorre har sitt ursprung i det fornnordiska ordet ikorne eller ikorn.[\[4\]](https://sv.wikipedia.org/wiki/Ekorre#cite_note-4)

Under antiken antogs att ekorren har sin långa svans för att ge sig själv skugga. Därför kallades djuret på grekiska för σκιοῦρος _skiuros_ (’skuggsvans’), som även återfinns i släktets vetenskapliga namn.[\[5\]](https://sv.wikipedia.org/wiki/Ekorre#cite_note-5)